Проверь параллельную работу вентилятора конденсатора и основного вентилятора радиатора — часто на Патриоте в пробках из-за разницы схем они включаются вразнобой из-за чего фреон не конденсится. У меня на Соболе похожая хрень была, пока не переделал включение обоих вентиляторов одновременно через реле.
Судя по всему, проблема в радиаторе кондиционера или вентиляторе охлаждения — на трассе поток воздуха помогает, в пробке нет. У меня на Куге было похожее на 213 тысячах: кондей сдох в пробке, пришлось менять радиатор кондея и чистить всю систему за 27 тысяч. Проверь, включается ли вентилятор радиатора кондиционера, когда давишь газ — если нет дело в нем.
Муфту вентилятора поменял — это хорошо, но смотри на радиатор кондиционера (конденсор): на Патриоте он часто забивается грязью между сотами, и в пробках обдув не справляется. При работающем вентиляторе охлаждения двигателя сам кондей может тупить из-за того, что вентилятор доп. охлаждения конденсора не включается или слабый поток воздуха — проверь реле и предохранители этого вентилятора. По фреону: если на трассе холодит, а в пробке нет — это не заправка, а именно теплообмен или электрика, у меня на Хонде так было, когда радиатор кондея грязью забило, после мойки изнутри и снаружи все встало на место.