Скорее всего, дело в самом реле вентилятора или в его цепи управления (блок предохранителей разъем или проводка) — раз напрямую вентиль работает, моторчик и питание целые. У меня на MX-5 подобное было кондей в пробках спасал, пока не заменил реле.
Смотри, на Королле классическая болячка — реле вентилятора или проводка к нему, если напрямую крутит, то предохранители и мотор целые, проверь блок реле под капотом и контакты фишек.
Скорее всего, проблема в реле вентилятора или в проводке к нему. Раз замкнув напрямую работает — значит сам мотор жив. Проверь контакты реле в блоке под капотом, бывает, что подгорают или окисляются, особенно после зимы. У меня на Фите похожая история была, поменял реле — и порядок.
Если замкнул напрямую — вентилятор крутит, значит мотор жив. Смотри реле вентилятора или цепь управления от ЭБУ. У меня на Одиссее похожая фигня была — окислился контакт в колодке реле, подогнул усики и заработало. Проверь заодно датчик включения вентилятора на радиаторе, если он двухскоростной — могла умереть одна из скоростей.