Проверь радиатор кондиционера: на нашем HR-V было так же, пока не промыл его отдельно от основного радиатора — грязь между ними создает тепловую завесу и вентилятор не продувает. Помпа на 5.3 редко умирает сразу, скорее всего, именно забитые соты на кондере дают такой эффект в пробке.
Скорее всего, проблема не в помпе — на ходу она бы давала о себе знать и при движении. Проверь вентилятор муфты: на холостых он может не включаться на полную мощность из-за износа вискомуфты или ошибки в управлении. Ещё глянь кондиционер — если он нагружает систему и радиатор забит грязью между сотами кондера и основного радиатора, толку от обдува ноль. У меня на ласточке было похожее после ревизии кондея — промыл все снятием, и пробки перестал бояться.
Проверь включение второго вентилятора и муфту вискомуфты — на пробках с кондеем один вентилятор часто не тянет, была похожая история на 200679, пока не заменил муфту и не промыл соты радиатора до дыр.