Судя по твоему описанию — термостат жив, а вот помпа вполне могла подсесть, лопасти на валу разболтались. У меня на Зафире такая же беда была после замены антифриза: в пробке ползет, на трассе — ок, пока не поставил оригинальную помпу. Глянь еще, не пузырит ли в расширительном бачке на холодную после стоянки — это скажет больше чем вентилятор.
Проверь для начала муфту вентилятора (если она вискомуфтой, а не электровентилятор в сборе) и радиатор снаружи на предмет пуха/грязи — на 99% причина в этом. На моем Берлинго была похожая история в жару после 70 тыс. км: вентилятор молотил вхолостую, пока не промыл радиатор и не проверил контактную группу термовыключателя. Термостат скорее всего жив, если на трассе греет как надо.
Проверь вентилятор: бывает, что он включается на одну скорость, а на вторую (высокую) не выходит — контакт или блок управления вентилятором. У меня на Кушаке в жару так же было, помогла чистка радиатора и проверка муфты помпы (на 1.0 TSI часто клинит на малых оборотах). По мелочи: если термостат не держит — будет наоборот долго греться, так что скорее именно радиатор забит пухом или недорабатывает вентилятор.
скорее всего, дело не в термостате или помпе, а в радиаторе. У Scala 1.0 TSI слабое место — радиатор охлаждения забивается грязью и пухом, особенно в пробках, когда кондиционер работает на полную. Мой совет: сними защиту вымой радиатор с химией и продуй сжатым воздухом, часто это решает проблему.