Судя по описанию, вентилятор тут ни при чем — на холостых он как раз и должен гонять воздух через радиатор кондея. Если на скорости холод есть, а в пробке пропадает, это почти всегда датчик давления хладагента или забитый термостат, из-за которого поднимается температура и кондей отключается. Проверь ещё включается ли вентилятор на малую скорость в жару — если нет, смотри реле и сам моторчик, у меня на Приоре похожая фигня была, оказалось, клемма окислилась.
Смотри в сторону электровентилятора радиатора: на холостых он должен включаться на максимальную скорость при нагрузке на кондей, если он не тянет — конденсатор обдувается плохо и давление фреона растет, компрессор отключается по аварии, отсюда и тепло. Проверь реле и сами щетки моторчика — на Navara это слабое место, часто клинит или окисляется разъем. Датчик давления тоже может мозг полоскать, но по симптомам, именно на остановках, вентиллятор первейший подозреваемый — когда едешь, набегающий поток дует сам, а в пробке спасает только принудиловка.
Скорее всего дело в муфте вентилятора охлаждения — на холостых она не включается, конденсатор не продувается, и давление в системе растет. Проверь, врубается ли он при нагреве, и заодно глянь на датчик давления хладагента — часто на наварах дурит именно он.
Смотри в сторону муфты вентилятора — на холостых она проскальзывает, радиатор не продувается и кондей давит горячим. У меня на Октавии такое же было, поменял муфту — и в пробках снова морозит.