Судя по симптомам, дело не в испарителе, а в датчике температуры воздуха после него. На малых оборотах поток медленный, датчик успевает сильно остыть и думает, что уже холодно, поэтому зажимает заслонку. На максимуме поток сбивает наледь или просто не дает датчику врать. Проверь разъем и показания датчика — это копеечная болячка на многих VAG, у меня на Патриоте другая схема, но тут механика та же. Если датчик жив, смотри заслонку смешивания — могла сбиться калибровка.
Скорее всего, дело не в испарителе, а в датчике температуры испарителя: он дурит и заставляет блок prematurely отключать компрессор на малых оборотах вентилятора. На максимуме поток воздуха успевает пройти пока компрессор выключен, поэтому ощущается холод. Попробуй для начала снять фишку с датчика — если кондей начнёт морозить на всех режимах, меняй его, это копейки.
Скорее всего, дело в датчике температуры испарителя: на малых оборотах он успевает подмораживаться, и электроника режет охлаждение до того, как вентилятор прогонит холод через салон. Проверь его контакты и сам термистор — на Шкоде это частая болячка, а менять его копейки. Еще вариант — забитый радиатор испарителя внутри, но раз на максимуме дует холодом, то я бы ставил на датчик.