Скорее всего проблема не в фреоне, а в сервоприводе заслонки смешивания воздуха — на Pajero Sport 2013 года это частая болячка после долгого стояния на солнце: пластик перегревается и механизм клинит. Проверь, меняется ли температура при переключении с холодного на горячее вручную, и прислушайся, есть ли характерный треск или щелчок из-под торпедо — на Тэане так лечится заменой сервопривода или перепрошивкой, на твоём Паджерике, вероятно, та же схема.
Судя по описанию, особенно по щелчкам компрессора и вентиляторам — скорее всего муфта компрессора подклинивает или умерла а компрессор может и не включаться по-настоящему. У меня на Тюгелле было похожее: кондей выдавал теплый, компрессор щелкал, но визуально муфта не схватывала — помогла замена муфты и зачистка контактов. Еще проверь реле компрессора и датчик давления на магистрали: на Паджеро часто глючат из-за перегрева после долгого стояния на солнце, фреон может быть в норме, а контакт окисляется. Уровень фреона проверял манометрами или просто на глаз? По опыту с прошлой замены фильтра салона и дозаправки — без ман
Проверь клапан расширения и датчик испарителя — у меня на Гольфе такое было после долгой стоянки на жаре, помогла замена клапана.