Проверь датчик температуры охлаждающей жидкости (ДТОЖ) и реле бензонасоса — на холодную часто дурит именно мозг из-за неверных показаний, а форсунки тут ни при чём, если теплый пуск стабильный.
Смотри датчик температуры ОЖ (ECT) — если врет, мозг льет богатую смесь на холодную. На 1.6 EP6 это частая болячка, проверь разъем и сопротивление, потом уже смотри форсунки на обратку. По мелочи глянь регулятор давления топлива, но начни с датчика — у меня на Солярисе похожая фигня была, поменял — заводится как миленький )
На фоне падения температуры проверь датчик температуры ОЖ — если врет, мозги льют богатую смесь на холодную, отсюда и долгий старт; у меня на Жуке после такой замены проблема ушла, а заодно глянь клапан адсорбера — частый косяк на этом моторе.